Posteriormente, pasó a formar parte de la secretaría técnica del conjunto catalán, camiseta real madrid hasta que en 1999 decide retornar a Sevilla y realizar el curso de entrenador nacional. El Coria CF, un conjunto históricamente ligado al Sevilla FC y a su gran valedor, Manolo Cardo, fue la primera entidad que confió en él, camiseta real madrid 2022 ofreciéndole el banquillo del Estadio del Guadalquivir. Al término de la temporada 1989/90, con 27 años, Francisco es traspasado por 50 millones de pesetas al RCD Español, cuyo técnico, Luis Aragonés, vislumbra el enorme potencial deportivo que aún tiene el canterano sevillista.
