Asimismo, en las temporadas de 1938 y 1939 consigue el Triplete de títulos tras ganar el Campeonato, la Copa Aldao y la Copa Ibarguren. Las divisiones inferiores de Independiente están categorizadas por edad, dividiéndose en: Cuarta, Quinta, Sexta, Séptima, Octava y Novena División. Incluyen 16 ligas de Primera División y 9 copas nacionales. Seguidamente, se convierte en el único club en ganar cuatro copas de manera consecutiva en 1972, 1973, 1974 y 1975, récord que mantiene hasta hoy.
